Храм в честь Усекновения главы Иоанна Предтечи с приделом на хорах в честь Обновления храма Воскресения Христова выстроен в годы управления обителью иеромонаха Афанасия (1824—1842) на средства дворян Михаила Ивановича и Ивана Ивановича Раевских. Впоследствии М. И. Раевского похоронили возле отстроенной им церкви. На стене находилась деревянная д(эска с надписью: «Здесь покоится тело основателя храма секунд-ротмистра Михаила Ивановича Раевского, дяди моего и благодетеля. Родился в 1767 году 14 апреля. Скончался в 1833 году 29 мая. От благодарной племянницы княгини Наталии Горчаковой». Рядом была еще одна надпись: «Здесь покоится тело полковничьей дочери девицы Прасковии Дмитриевны Червиной. Родилась 1805 г. 2 декабря. Скончалась 1828 г. 7 апреля. Пожертвовала 100 рублей ассигнациями». 5 декабря 1865 года Иоанновский храм после проведенного в нем ремонта был освящен игуменом Давидовой пустыни Иосифом, он же пожертвовал из казны Давидовой пустыни 1000 рублей серебром на возобновление церкви. Крестьянин села Озеры Василий Щербаков пожертвовал в алтарь храма позолоченный киот с иконой Спасителя. Иоанновская церковь, как и другие здания Белопесоцкого монастыря, сильно пострадала в наводнение 1908 года. После окончательного закрытия монастыря в 1933 году в здании храма разместилась стекольная фабрика. Согласно решению 1989 года о преобразовании территории Белопесоцкой обители в историко-культурный центр, храм Усекновения главы Иоанна Предтечи предназначался под концертный зал. В настоящее время Иоанновская церковь восстановлена. В ней хранится чтимая икона Божией Матери «Скоропослушница».